11月3日黎明，载运哥伦比亚军队的哥伦比亚轮船“卡塔赫纳号”驶入了科隆港。上午八点，这一支共有四十人的部队，在胡安.托瓦尔和拉蒙.阿马亚两位将军率领下登上了岸。巴拿马铁路公司主管人、美国上校谢勒很恭敬地迎上前去。托瓦尔和阿马亚要求马上运送他们的部队去巴拿马城。谢勒声称眼前没有机车车辆。这位美国上校说的是真实话：他为了执行国务院的指示，在头天晚上已把全部机车车辆调走了。谢勒上校向两位将军保证说，下午一点钟能调来一列火车，军队就可运往巴拿马城。他建议两位将军乘坐由一辆机车和一节车厢组成的“专车”先走。两位哥伦比亚将军满心怀疑地上了“专车”。他们想了想，觉得留下自己的部队不大妥当。但是，他们刚决定要从招待车上下来时，殷勤的美国人已发出开车的信号，火车就开动了。那些哥伦比亚军队留在那里无人领导。

当天中午，两位将军抵达巴拿马城，受到了奥瓦尔迪亚省长和哥伦比亚驻防军首领乌埃尔塔斯将军这两个叛徒的隆重欢迎。

就在这时(1903年11月3日下午3点40分)，美国代理国务卿卢米斯给美国驻巴拿马副领事费利克斯.埃尔曼发来了一份电报：“据悉地峡发生起义。速即详报国务院。”

副领事埃尔曼立即回电说：“起义尚未发生，据悉晚上发动。局势紧急(重点为作者所加)。”

美国代理海军部长达林也给停泊在科隆港的“纳什维尔号”舰长发来了指示：“为了世界利益，请竭尽全力，不让哥伦比亚政府军从科隆开赴巴拿马城。地峡过境交通必须自由开放，秩序必须维持。”

就这样，“为了世界利益”，美国军队奉令反对哥伦比亚，而支持当地的巴拿马“爱国者”。

哥伦比亚托瓦尔将军终于感觉到，在豪华的接待后面藏着某种不祥的东西。他向乌埃尔塔斯将军宣布，他要接管巴拿马驻防军的指挥权，并坚持要立即检阅军队。于是，在下午5点钟时，叛徒乌埃尔塔斯就下令逮捕了托瓦尔将军。在托瓦尔被捕以后，“爱国者们”的首领阿马多尔下令逮捕了巴拿马省长奥瓦尔迪亚，这道手续是事先已跟奥瓦尔迪亚商定了的。逮捕省长是体现推翻哥伦毕亚政权所必需的。象这样推翻了省长以后，阿马多尔便通知美国领事馆说，巴拿马已断绝了同哥伦比亚的关系。

隔了不多久，美国副领事向国务院报告说:“今天傍晚6点起义爆发，没有流血。陆、海军军官已被俘虏。今天就要组织政府……”这份电报发出以后过了几分钟，阿兰戈、博伊德和阿里亚斯宣告由他们组成临时执政委员会，并走到大教堂广场上向“人民”宣布这件事。

哥伦比亚炮艇“波哥大号”正停泊在巴拿马港口。炮艇全体官兵听说托瓦尔将军、阿马亚将军以及陪送这两位将军的该炮艇艇长都被捕了，就宣布说:如果到晚上10点不把被捕的人全部释放，炮艇就要向巴拿马城开火。不久，“波哥大号”炮艇轰击了巴拿马城，但是，没等达到自己的要求，它就驶往哥伦比亚的一个港口去了。