11月3日晚上，巴拿马市议会召开了一次特别会议。市议会“承认”了巴拿马新政府，并定于是11日4日正式宣布共和国成立。

在托瓦尔将军和阿马亚将军前往巴拿马城以后，留下来的哥伦比亚军队由托雷斯上校率领。他在一天之内向巴拿马铁路公司主管人交涉了三次，坚决要求把军队运往巴拿马城。最初，美国上校谢勒向托雷斯声称：必须经巴拿马省长的批准才能调运军队。谢勒知道巴拿马省长是站在阴谋分子一边的，因此他相信得不到这种批准。不但如此，他甚至没有就这件事向省长征询意见。后来，谢勒还故意嘲弄地提出:要给全体士兵购买车票。这简直是对1846年条约的蛮横无礼的破坏。

下面这件事很耐人寻味，并且非常重要。对“纳什维尔号”舰长曾下达过指示，不让哥伦亚军队从科隆调往巴拿马城。但发生了这样一利情况：美国国务院未能证实“纳什维尔号”舰长是否接到这个命令。是否接到这个命令。美国驻科隆领事马尔姆罗斯对这件事也无所知闻。

焦急不安的美国代理国务卿卢米斯在11月3日下午4点钟询问马尔姆罗斯，哥伦比亚军队是否已经上岸。过了半小时，他又询问马尔姆罗斯：是否收到给“纳什维尔号”舰长约翰.哈伯德的指示。美国领事回电说，哥伦比亚军队已经上岸，但是他没有接到给哈伯德的指示。于是，晚上8点45分，卢米斯给马尔姆罗斯发来了如下的电报:“从‘卡塔赫纳号’军舰登陆的军队不得开赴巴拿马城。”

晚上10点30分，马尔姆罗斯又收到了新的电报，但这一次是国务卿哈伊本人打来的。电文说:“给‘纳什维尔号’的指示如尚未交到，就立即通知该舰舰长，要该舰切勿容许政府军开往巴拿马城和参与任何可能引起流血的行动。”

尽管这样，美国国务院仍不放心。半夜11点18分，卢米斯又向驻巴拿马城领事发出了一份电报。在电文中除了复述给“纳什维尔号”舰长哈伯德的指示以外，还命令包一列专车前往科隆城，以便亲手把指示递交给哈伯德。马尔姆罗斯便吩咐用电话将这一通知向科隆方面传达。

美国上校谢勒在向“纳什维尔号”舰长转告这一电话传达时，还告知他在巴拿马已经成功地举行了“革命”的消息。到这时候，舰长哈伯德才给谢勒下了正式命令：不准运送哥伦比亚军队去巴拿马城。

美国上校谢勒在向“纳什维尔号”舰长转告这一电话传达时，还告知他在巴拿马已经成功地举行了“革命”的消息。到这时候，舰长哈伯德才给谢勒下了正式命令：不准运送哥伦比亚军队去巴拿马城。

哈伯德舰长还给哥伦比亚军队指挥员托雷斯上校写了如下的书面通知：“据我所知，巴拿马城内局势紧张，现在科隆的哥伦比亚军队开进该城将会引起冲突。对于美国承担责任予以保障的地峡自由过境，可能会出现使之中断的威胁。为此，我荣幸地预先通知您:我已给在科隆的巴拿马铁路经理下了命令，无论是政府军，或是贵方敌人的军队都不得予以运送。”